Hace algún tiempo hicimos un cursillo informal de introducción a la filogenia, en el que tratamos desde los conceptos básicos hasta los diferentes métodos que se usan para construir los árboles. Se estructuró en las siguientes partes:

1. Hablando con propiedad: árboles, clados y nomenclatura.
2. Los datos: tipos y formatos de archivo.
3. Gaps y missing data.
4. Métodos de distancias: UPGMA, modelos de sustitución nucleotídica, Neighbour Joining, bootstrap.
5. Métodos cladísticos: Máxima Parsimonia, árboles consenso.
6. Máxima Verosimilitud: aplicaciones, alineamientos.
7. Inferencia Bayesiana.
8. Datación.

Dejo aquí el texto guía y las presentaciones.

Texto guía

Presentación (primera sesión)

Presentación (segunda sesión)

En mis ratos libres estoy ultimando una segunda versión, añadiendo tutoriales para realizar las tareas más sencillas y corrigiendo algunos errores. Estará disponible próximamente.