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La simulación consta de una ventana en la cual podemos elegir los modos de vibración molecular a estudiar. Se deben elegir antes de comenzar la simulación.
Los valores de la izquierda son las condiciones iniciales para una molécula de CO2
Si se desea cambiar estos valores, debemos hacerlo antes de iniciar la simulación. A la derecha vemos como varían la longitud de los enlaces y del ángulo, además del tiempo.
Cuando la simulación está en marcha, es posible visualizar una serie de gráficas que aclaran lo que estamos viendo, por ejemplo una gráfica donde se visualiza el incremento de los enlaces o otra donde se ve el incremento del ángulo de enlace. Con ellas podemos analizar loq ue vemos, por ejemplo en el modo no simétrico vemos que las graficas estan desfasadas.
Además,
podemos visualizar la energía como mera confirmación de que es constante, es
decir que la simulación respeta la conservación de la energía, pues la
simulación supone que las fuerzas externas son nulas. La vibración por lo tanto
será eterna (bueno, o hasta que nos cansemos de mirarla y finalicemos la simulación).
También vemos en la simulación unos vectores que nos indican la velocidad
relativa de las partículas entre ellas mismas. Este hecho sirve más que nada
para facilitar la observación de la simulación.